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赣州电子工业技术学校的毕业证书与普通高中毕业证书并不具有完全同等的效力。赣州电子工业技术学校颁发的证书更多地偏向于职业技能教育，强调实践技能的培养。而普通高中毕业证书则更注重基础学科教育。因此，两者在学历认可、进一步深造或就业方面可能存在差异。具体效力还需根据用人单位或教育机构的要求来确定。