吉安市特殊教育学校的毕业证书与普通高中毕业证书并不具有同等效力。特殊教育学校根据学生接受的教育和程度颁发证书，这些证书是针对特殊教育的，与普通高中教育有所不同。因此，它们的效力并不相同。普通高中毕业证书是普遍认可的，而特殊教育毕业证书的效力则取决于其教育和社会的认可程度。